Saint‑Aubin‑sur‑Yonne est un village niché entre la forêt et la rivière, au cœur d’un environnement naturel préservé. Du Vᵉ au XVᵉ siècle, le bourg et ses hameaux, situés sur l’axe reliant Joigny à Sens, à la frontière entre Champagne, Bourgogne et domaine royal, ont connu de nombreuses destructions, notamment durant la guerre de Cent Ans.
Il ne subsiste aujourd’hui que quelques traces des châteaux successifs et de l’ancien monastère. L’église classée, dédiée à Saint‑Aubin — qui a donné son nom au village — demeure un remarquable témoignage de l’architecture des XIIᵉ et XIIIᵉ siècles.
La viticulture, l’exploitation forestière et les activités fluviales ont longtemps constitué les principales ressources locales. Le canal de dérivation, creusé en 1868, ainsi que les contreforts de la forêt d’Othe, offrent aujourd’hui un cadre naturel de grande qualité, propice à la découverte et à la promenade.